Im Frühjahr 1989 gründeten fünf Deutsche Jugendliche die Band "Raise Hell", beeinflusst von Bands wie Destruction, Slayer und frühe Metallica. Schon in ihren Anfangsjahren erhielt die Band viel Aufmerksamkeit seitens der lokalen Presse. Viele Mitgliederwechsel führten einen Stilwechsel hin zum Death Metal herbei. Als Konsequenz wurde der Name der Band zu APOPHIS abgeändert. Das erste stabile Line-up bestand aus Kristian Hahn (Gesang), Roger Kirchner (Gitarre), Jörg Barthelt (Gitarre) und Erik Stegmaier (Schlagzeug). Diese Besetzung blieb bis auf die ständig wechselnde Bass Gitarristen über 10 Jahre konstant.
Im Jahr 1991 nahm man das erste und einzige Demo "Missed Abortion" auf. Als spezielles Feature musste der Käufer das Cover selbst mit Farben versehen.
Im Dezember 1992 wurde die erste CD "Gateway to the Underworld" aufgenommen und von Nuclear Blast sowie SPV vertrieben. Sie gilt noch immer als die progressivste CD der Band. Die Band spielte die nächsten Jahre viel live und konnte die Bühne mit Größen wie Pungent Stench, Crematory und Fleshcrawl teilen.
Nachdem Erik ein Jahr in Amerika verbrachte, wurde 1999 das zweite Album "Down in the Valley" aufgenommen und im gleichen Jahr von Contraption Records veröffentlicht, vertrieben wurde es von Last Episode und IRS.
Es war 1997, als die Band mit dem deutschen Death Metal Label Morbid Records ein neues zu Hause fand. Man enterte die slowakischen Exponent Studios, um das dritte Album "Heliopolis" aufzunehmen. Das Album unterstrich die Einzigartigkeit und Qualität der Musik von APOPHIS.
Um das Album weiter zu pushen, spielte die Band die nächsten 2 Jahre sehr viel live, unter anderem auf dem Summer Breeze und eine Tour mit Sinister und Disinfect. Inzwischen hatten APOPHIS den Vertrag mit Morbid Records in beidseitigem Einvernehmen aufgelöst.
2003 ging man zurück in die Exponent Studios, um "I Am Your Blindness" mit dem Line-up Roger (Gitarre, Gründungsmitglied), Erik (Schlagzeug, Gründungsmitglied), Patrick (Bass, ex-Dark Reality), Anton (Gitarre) und André (Gesang) aufzunehmen. Kurz nach den Aufnahmnen verließ André die Band und Bernd schloss die so entstandene Lücke, während an den Gitarren Anton durch Jens ersetzt wurde.
Im Jahr 2005 unterschrieben APOPHIS einen Vertrag mit Supreme Chaos Records, um das Album für die Fans der Band verfügbar zu machen.